各种生物信息学软件都有

生物芯片表达谱分析技术

Biochip Expression Profile Analysis Technology

课程编号： X10005 开课教研室： 系统生物学教研室

总学时数： 20 学 分： 1

主讲教师： 郭政 开课学期：第1学期

教材名称： 自编讲义

课程简介： 本课程讲述生物芯片从概念的提出及发展过程，系统介绍基因芯片的原理、类型、制备、检测、数据存储管理与处理分析以及在基因表达、基因多态性、病原体检测、新药筛选等方面的应用，最后对其他生物芯片也做一定介绍和展望。主要教授基因芯片表达谱数据库的相关知识以及以此为数据源的几种科研分析软件的用法。

教学目的： 了解生物芯片（重点基因芯片）的原理、制备、数据检测、数据处理与分析。 教学重点及要求掌握的内容：

一、简略讲解芯片的杂交和探针筛选原理（4学时）

1. 微珠芯片原理简介

2. Affymatrix芯片原理简介

二、差异表达基因筛选方法及相关软件（4学时）

1. Significance Analysis of Microarrays

2. Arraytool简介

三、基因、蛋白质功能注释与分类体系以及功能模块筛选方法及相关软件（4学时）

1. Gene Ontology计划

2. 蛋白质互作网络以及其拓扑特征

四、基因与蛋白质功能研究的生物芯片信息学技术（4学时）

1. 条件相关的蛋白质互作子网络

2. 组织特异的蛋白质互作子网络

五、生物信息融合分析技术（4学时）

1. 如何结合基因表达信息解析蛋白质互作网络，识别条件特异应答子网，发现其功能模块化组织关系