各种生物信息学软件都有

医学结构生物信息学

Structural Bioinformatics in Medical Research

课程编号： X10007 开课教研室： 生物物理学教研室

学 分： 1学分 总学时数： 20学时

主讲教师： 陈丽娜

教材名称： 结构生物信息学

出 版 社： 化学工业出版社

出版时间： 2009年3月 开课学期： 第1学期 主 编： B．E波恩 H．魏西希

课程简介： 生物系统的高分辨结构信息将允许我们对生命系统的功能、对系统修饰或扰动的后果进行精确的解释和推理。这一结构信息的展现与日益增长的基因组、蛋白组、代谢组信息相联系，为分析生物医学问题提供了强大的研究背景。本课程侧重以基础理论与科研实例相结合的方式，介绍特定结构生物分子在生物通路和重要细胞过程中的作用；同时深入讲解结构生物学信息的方法，在复杂疾病基因挖掘、功能蛋白设计(药靶设计)及蛋白质功能预测等方面的应用。

教学目的： 通过本课程的学习，使学生了解结构生物信息学研究内容及方法，掌握常用的结构生物信息学数据库及相关软件的原理和使用方法，能够根据结构生物学数据资源设计并开展生物医学相关领域课题的研究。

教学重点及要求掌握的内容：

一、结构生物信息学简介（4学时）

1．结构生物信息学基础

主要掌握结构生物信息学的概念和研究的内容；熟悉生物分子的基本结构特征；了解结构生物信息学的起源、研究现状和未来发展趋势。

2．生物分子结构解析技术

主要介绍生物分子结构解析的实验技术和信息学处理方法，要求了解实验技术和信息学处理方法的基本范畴：实验技术包括NMR波谱分析技术、X射线衍射技术、近场光学光谱技术、表面等离子体激元共振技术等获得生物大分子的静态或动态结构信息；信息学处理方法主要包括结构比对方法、高级结构预测方法和可视化软件等。

3．结构生物信息学数据库

主要讲授生物分子结构相关的数据库基础，介绍结构数据库分类和生物分子结构相关的功能信息，要求掌握PDB、SCOP、CATH、HOMSTARAD和CAMPASS等数据库中数据存储格式及使用方法等。

二、结构域蛋白质组学（4学时）