各种生物信息学软件都有

3. 生存曲线的比较

4. Cox比例风险回归模型

三、基因集分析方法 (4学时)

1. 单基因分析与基因集分析

2. 基因集分析中的两个零假设及模型

3. 基于基因和类别标签两种permutation方法

4. 常见基因集分析软件及比较

5. SNP基因集分析方法简介

四、生物信息学方法在计算表观遗传学研究中的应用 (4学时)

1. 计算表观遗传学发展简介

2. DNA甲基化芯片数据的处理方法

3. 最新DNA甲基化分析软件

4. 基于高通量测序技术识别组蛋白修饰谱

5. 基于组蛋白修饰预测基因表达的方法

五、与癌症相关的表观遗传谱矩阵分析 (4学时)

1. 表观遗传学与癌症

2. 癌症差异甲基化区域的筛选方法及分析

3. 常用的癌症表观遗传学相关的数据库介绍

参考书目及文献：

1.于秀林，任雪松编著，多元统计分析，中国统计出版社，2005

2.北野宏明编，刘笔锋，周艳红等译，系统生物学基础，化学工业出版社，2007

3.贺福初，杨芃原，朱云平主译，系统生物学的理论，方法和应用，复旦大学出版社，2007

4.表观遗传学，C.D. 艾利斯，科学出版社，2008