各种生物信息学软件都有

目录生物信息学软件(X10001)………………………………………………………………… 1 生物信息挖掘技术 (X10002)……………………………………………………………… 3 功能基因组学(X10003) …………………………………………………………………… 5 统计遗传学研究进展 (X10004) ……………………………………………………… 7 生物芯片表达谱分析技术(X10005)……………………………………………………… 9 医用多因素分析 (X10006) ……………………………………………………………… 11 医学结构生物信息学(X10007)………………………………………………………… 13 SCI 论文与学位论文写作(学院自开课程)……………………………………………… 16

各种生物信息学软件都有

生物信息学软件

Bioinformatics software

课程编号： X10001

总学时数： 20学时

主讲教师： 肖 云

教材名称： 生物信息学

出 版 社： 人民卫生出版社

出版时间： 2010年 主 编： 李 霞 开课教研室： 生物信息教研室 学 分： 1学分 开课学期： 第1学期

课程简介：生物信息学软件主要是为研究生开设的基础课。课程内容为生物信息相关专业课程（，课程内容的体系结构涉及功能注释、表达分析以及网络分析等，主要为培养我院各专业研究生灵活运用软件解决问题的能力，使学生通过本课程的学习，能够熟练掌握一些主要的生物信息学软件。

教学目的：该门课程学习的目的，是使学生熟练掌握一些应用广泛的生物信息学软件，并能运用所学软件分析和解决生物信息科研中的实际问题。本课程从多个层面覆盖生物信息各方面常用的软件，如生物学功能注释、系统生物学分析等。本课程重点讲授Cytoscape及其插件的应用。

教学重点及要求掌握的内容：

一、注释软件 Biomart（2学时）

1. 简介 bioMart是一个集成了生物学数据的大型集成数据库，包括Ensemble, Uniprot, NCBI, EBI, TAIR等常用的数据库

2. 主要功能 它可以轻松地完成的在多个生物学数据库上繁琐地检索，获取相关数据在不同数据库间的关联。

3. 实例分析 查找某个基因在染色体上的位置。反之，给定染色体每一区间，返回该区间的基因s

二、功能分析软件 David（2 学时）

1. 主要功能 主要用于基因的功能富集分析，包括GO富集分析以及KEGG通路富集分析.

2. 实例分析 给定某一基因集合，分析其显著参与的生物学过程