猪戊型肝炎(16)

研究生论文

图1-2 HEV基因组结构图

A：缅甸株基因组结构图 B：T1株基因组结构图

ORF1:MT= 甲基转移酶 Pro=木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶 Helicase=RNA解旋酶 Replicase=RNA依赖的RNA聚合酶

ORF2

ORF3：？：功能不明

1.3.2.2编码蛋白

HEV基因Ⅰ～Ⅲ型和基因Ⅳ型的3个ORF编码产物大小不同，基因Ⅳ型ORF1、ORF2和ORF3编码的蛋白质长度分别是1707aa、 672aa和123aa，而基因Ⅰ～Ⅲ型分别是1693aa、 660aa和112aa 。基因Ⅳ型ORF2和ORF3多肽氨基端明显不同，但通过计算机分析显示，改变后的ORF2和ORF3仍有完整的信号肽，说明虽然基因结构发生了改变，但仍能保证其正常的功能。

（1） ORF1编码蛋白（p ORF1）

ORF1主要编码与病毒RNA复制有关的非结构蛋白（Khoonin EV, 1992 ）。p ORF1氨基酸序列所含的多种功能性结构域从N端到C端分别为病毒甲基转移酶；功能未知的Y结构域，木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶，富含脯氨酸的“铰链”结构域，功能未知的X结构域，RNA解旋酶和RNA依赖的RNA聚合酶。

p ORF1中甲基转移酶结构域的存在提示HEV基因组RNA具有5’帽子结构，此已被证实（Lazizi Y et al.,1999；Zhang M et al., 2001）。重组HEV基因组的体内感染实验（Emerson SU et al.,2001）表明，HEV基因组的5’帽子结构是HEV保持活力和感染性所必须的。Magden 等也证（Magden J et al., 2001）。这为抗病毒实在昆虫细胞中表达的p ORF1其活性可被帽结构类似物抑制药物的研制提供了理想的靶向。

RNA依赖性RNA聚合酶可与基因组RNA 3’端特异性结合，从而指导互补链RNA的合成，基因组RNA3’端的两个茎环结构SL1和SL2以及poly（A）尾是特异结合所必须的（Agrawal S et al., 2001）。

ORF1第2011～2325nt为HEV相对高变区，编码为100aa,由于ORF1编码的蛋白不在病毒表面，并不需要不停的改变以逃避宿主免疫系统的压力，该高变区可能与HEV重要功能基因相对稳定，而不重要的基因区高度突变以适应病毒的生存和进化。

（2） ORF2编码蛋白（p ORF2）

ORF2为主要的结构基因编码区，p ORF2分子量约为75KD。对其氨基酸序列的分析显示其具有典型的病毒衣壳蛋白特征（Tam AW et al., 1991），即在N端起始密码子之后，由18个疏水性氨基酸（5～22）构成典型的信号肽序列和一个富含碱性氨基酸的衣壳样区域，并含有潜在的切割位点，这与HEV的颗粒形成有关。

Zafrullah等通过对HEV ORF2蛋白糖基化的分析，认为在哺乳动物细胞中表达的p ORF2首先被合成82 KD的前体，之后被切掉信号加工为74KD的p ORF2，最后进一步糖基化加工成88 KD的