代谢相关蛋白质修饰在肿瘤发生发展过 程中的作(13)

时间:2025-03-10

酶活力,研究磷酸化对蛋白功能的调控;采用western blotting方法检测蛋白质的 乙酰化、 磷酸化、 甲基化或羟基化, 采用自制或商业购买的抗乙酰化赖氨酸探测, 用GE公司的ECL plus显色,GE公司的Typhoon Trio扫描仪检测;采用siRNA或 shRNA方法对需要敲落的相关基因进行敲落,采用knock in,overexpress等方法在 细胞中表达需要的基因。采用Tandem Affinity Purification (TAP)及免疫共沉淀 技术鉴定及确认参与代谢酶乙酰化的修饰酶;各个代谢酶、代谢酶修饰酶(乙酰 化酶及去乙酰化酶)以及各种双加氧酶(PHD、组蛋白去甲基化酶、DNA去甲 基化酶)的酶活的测定将按照文献方法进行。 2. 通过培养的细胞系研究代谢物对细胞表观遗传及下游信号通路的调控。 通 过外源添加细胞膜可渗透的代谢物衍生物,如酯化的?酮戊二酸、延胡索酸、琥 珀酸等,改变细胞内的特定代谢物的浓度,检测组蛋白甲基化水平、DNA甲基 化水平以及包括HIF家族在内的蛋白羟基化水平,同时研究因这些改变导致的下 游效应,生化检测方法同上;在改变细胞代谢物浓度的条件下运用microarray、 Chip seq 等手段研究因代谢中间物改变引起的组蛋白或DNA甲基化变化调控的 下游基因表达变化以及蛋白与细胞核内不同功能DNA区段的互作情况,并运用 生物信息学方法进行分析和数据整理。 3. 建立动物模型研究翻译后修饰对于代谢的调控,以及修饰失调的病理效 应。在小鼠模型中敲除/敲入特定的一个或数个修饰酶/代谢酶,研究这些改变对 于小鼠代谢组、信号通路的影响。重点研究可加强/抑制Warburg effect的乙酰化 调控动物模型的肿瘤发生率的改变; 研究通过改变乙酰化修饰酶调节细胞?酮戊 二酸、延胡索酸、琥珀酸的动物模型,研究这些改变对于肿瘤发生的促进/抑制 作用。

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