百合ACC氧化酶基因全长cDNA的克隆及序列分析(5)

发布时间:2021-06-06

百合ACC氧化酶基因全长cDNA的克隆及序列分析

(EU296623)最先与百合科郁金香(BAE20195,BAE20196,BAE20197)聚类合并,其次与双子叶植物(天竺葵AAB70883,花叶木薯ABK59094,欧洲白桦ACO2AAN86821,牵牛ABL67954,天竺葵ACO3AAB70884等)聚类,最后与单子叶植物兰科(卡特兰AAT02192,蝴蝶兰AAT02194)与禾本科

植物(毛竹BAB32502,甘蔗ABM74187)聚类(图7).聚类分析结果表明,本研究克隆的ACO基因与双子叶植物的亲缘关系更近,与单子叶植物一些.

聚类分析发现,欧洲白桦ACO(AAN86821)与欧洲白桦ACO2(CAA71738)没有聚为一类,反而是梅(BAA90550)与欧洲白桦ACO(AAN86821)聚

表1 百合ACO基因和已知其它植物的ACO基因核苷酸与推导的氨基酸序列相似性比较Table1 AlignmentofEU296623andsomeplantACOnucleotidesequencesandaminoacidinGenBank

物种Plant

郁金香Tulipagesneriana(ACO3)郁金香Tulipagesneriana(ACO2)郁金香Tulipagesneriana(ACO1)桑Morusalba(ACO)

向日葵Helianthusannuus(ACO)梅Prunusmume(ACO)

甘蔗Saccharumofficinarum(ACO)牵牛Ipomoeanil(ACO)绿茶Camelliasinensis(ACO)花叶木薯Manihotesculenta(ACO)欧洲白桦Betulapendula(ACO)欧洲白桦Betulapendula(ACO2)

天竺葵Pelargoniumhortorum(ACO3)天竺葵Pelargoniumhortorum(ACO)毛竹Phyllostachysedulis(ACO)卡特兰Cattleyalabiata(ACO)蝴蝶兰Phalaenopsisamabilis(ACO)

GenBank的登录号AccessionNo.inGenBank

AB232767AB232766AB232765DQ785807L29405AB031027EF189711EF127818DQ904328EF035079AY154649Y10749U67861U19856AB044747AY598793AY598795

相似性Similarily/%

核苷酸Nucleotide

8082827472727372737173737374737271

氨基酸Aminoacid

8786857775727272727272727274717070

图7 Mega软件分析不同来源的ACO基因推导的氨基酸序列聚类分析结果

Fig.7 PhylogeneticanalysisofaminoacidsequencesofACOfrom

sugarcaneandotherplantsinGenBankdatabase

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