百合ACC氧化酶基因全长cDNA的克隆及序列分析(4)

百合ACC氧化酶基因全长cDNA的克隆及序列分析

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西 北 植 物 学 报 28卷

量为36.22KD.该基因暂时命名为LACO,其Gen Bank登录号为EU296623.

2.3.2 百合ACO基因核苷酸序列与推导的氨基酸序列同源性及系统进化分析 LACO核苷酸序列与已报道的其它植物ACO基因序列有71%~82%的相似性,与百合科的郁金香相似性最高,均在80%以上,其次是桑树、向日葵、梅、毛竹、卡特兰、蝴蝶兰等(同源性分别为74%、72%、72%、73%、72%和71%),同源性均在70%以上(表1).结果表明,本研究从百合中克隆到的ACO基因与已报道双子叶植物核苷酸序列相似性高于单子叶植物.

从LACO推导的氨基酸序列与已知其它植物ACO基因序列同源性有70%~87%相似性,其中与郁金香ACO基因相似性最高,为85%以上,其次是桑树、向日葵、绿茶、牵牛、蝴蝶兰、卡特兰、毛竹等,相似性分别为77%、72%、72%、71%、70%和70%(表1).结果表明,本研究从百合中克隆到的ACO基因推导的氨基酸序列与大部分已经报道的双子叶植物相似性高于单子叶植物.

对GenBank同源性搜索获得的其它植物ACO基因氨基酸序列进行系统进化分析,发现百

合

图5 重组质粒的鉴定

M.DL2000;1.cDNA全长片段的重组质粒PCR检测;

2.EcoR#酶切含cDNA全长片段的重组质粒

Fig.5 Identificationofrecombinantplasmid

M.DL2000;1.Identificationofrecombinantplasmidcontaining

productsofthefull lengthgenewithPCR;2.Digestion

ofrecombinantplasmidcontainingproductsof

thefull lengthgenewithEcoR#

2.3 生物信息学的分析

2.3.1 百合ACO基因cDNA全长核苷酸序列分析 测序得到百合ACC氧化酶基因的全长cDNA核苷酸序列大小为1152bp,其中起始密码子ATG位于34bp处,终止密码子TAA(即终止子)位于987bp,推导的氨基酸序列含318个氨基酸(图6),分子

图6 百合ACO基因cDNA全长的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列

Fig.6 Nucleotidesequenceanddeducedaminoacidsequenceofthefull lengthACOcDNA