核酸的分离与纯化_百替生物(6)
发布时间:2021-06-05
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RNase对RNA的降解,而且RNA极易溶于甲酰胺溶液,其浓度可高达4mg/ml。需要注意的是,这些所谓RNA酶抑制剂或有机溶剂的加入,只是一种暂时保存的需要,如果它们对后继的实验研究与应用有影响,则必须予以去除。
由于反复冻融产生的机械剪切力对DNA与RNA核酸样品均有破坏作用,在实际操作中,核酸的小量分装是十分必要的。
(三)核酸的应用
分离纯化的核酸样品,既可用于核酸本身功能与性质的研究,亦可利用其功能与性质进行广泛的应用,如基因工程与蛋白质工程均以核酸分子作为原始材料。可以说,目前包括聚合酶链反应,核酸的分子杂交与DNA重组与表达技术在内的绝大多数分子生物学技术,都是以核酸分子为处理对象,利用核酸分子的碱基配对原理与核酸的一种或多种酶修饰性进行的。绝大多数分子生物学技术,实质上是对DNA和RNA的分析。没有核酸的分离与纯化,分子生物学技术就没有研究与应用的基础。
第二节 基因组DNA的分离与纯化
一、分离与纯化的方法
双链DNA因固有的结构特点,是一种惰性很强的化学分子,可用于重现犯罪现场和进行古生物学分析。但由于是很长的线性分子(如人的染色体DNA平均长度为100~150Mb)而且缺乏横向的稳定性,因此很容易断裂。在溶液中,由于碱基堆砌力的相互作用与磷酸基团的静电排斥作用,DNA分子非常粘稠,沉淀后很难溶解,而且也增加了它对剪切力的敏感性。即便是最轻柔的方式,高分子量的DNA也很容易因剪切力发生横向的断裂。常规方法分离基因组DNA时,大于150kb的DNA分子很容易发生断裂。
(一)酚抽提法
本法最初于1976年由Stafford及其同事提出,通过改进,以含EDTA、SDS及无DNA酶的RNA酶的裂解缓冲液裂解细胞,经蛋白酶K处理后,用pH8.0的Tris饱和酚抽提DNA,重复抽提至一定纯度后,根据不同需要行透析或沉淀处理,获得所需的DNA样品。
其中,EDTA为二价金属离子螯合剂,可以抑制DNA酶的活性,同时降低细胞膜的稳定性;SDS为生物阴离子去垢剂,主要引起细胞膜的降解并能乳化脂质和蛋白质,与这些脂质和蛋白质的结合可以使它们沉淀,其非极性端与膜磷脂结合,极性端使蛋白质变