核酸的分离与纯化_百替生物(14)
发布时间:2021-06-05
发布时间:2021-06-05
二硫键,有利于RNase的变性、水解与灭活。
二、总RNA的分离与纯化
由于RNase的影响,为获得完整的RNA分子,就必须在总RNA分离纯化的最初阶段,尽可能快地灭活胞内RNase的活性。在β-巯基乙醇的协同作用下,高浓度的(异)硫氰酸胍可以极大极快地抑制RNase的活性,能从胰腺等富含RNase的组织细胞中分离出完整的RNA分子,目前已成为常规使用的试剂。pH8.0的Tris饱和酚用于DNA的制备,但在RNA纯化时,应使用pH4.5~5.5的水饱和酸性酚,这既有利于DNA的变性又有利于RNA的分离。尽管对剪切力不敏感,但RNA具有碱易变性,需要严格控制pH值。另外,在DNA与RNA的提取过程中,酚与氯仿经常结合、交替使用,主要在于两者合用时去除蛋白的效果更好,而且氯仿还能有效抑制RNase的活性,通过使酚脱水防止mRNA的丢失,加速有机相与水相的分层,去除植物色素和蔗糖以及核酸样品中的痕量酚。少量异戊醇的加入,其目的在于消除抽提过程中因蛋白质变性而产生的泡沫。由于高浓度胍类的使用,为防止SDS的沉淀,常改用十二烷基肌氨酸钠。对含量较低的样品,加入糖原可以提高RNA的回收率。
总RNA提取法中最常使用的是一步法。需要指出的是,目前常用的一步法均以异丙醇沉淀RNA,由于其选择性地沉淀大分子rRNA和mRNA,故提取的总RNA中含有的小分子量RNA较少,rRNA和mRNA所占的比例相应增高。当然,目前的研究重点不是小分子量RNA,而是分子量较高的mRNA,不必苛求真正的总RNA。
(一)(异)硫氰酸胍-酚氯仿一步法
(异)硫氰酸胍-酚氯仿法是经典的一步法,由Chomczynski和Sacchi 于1987年提出。它以含4mmol/L的(异)硫氰酸胍与0.1mmol/L的β-巯基乙醇的变性溶液裂解细胞,然后在
pH4.0的酸性条件下,用酚/氯仿抽提裂解溶液,最后通过异丙醇沉淀与75%的乙醇洗涤来制备RNA。该法与以前的(异)硫氰酸胍-CsCl超速离心法相比,具有简便、经济和高效的特点,能同时迅速地处理多个标本,且RNA的完整性与纯度均很高。目前仍用于从培养细胞和大多数动物组织中分离纯化总RNA。总RNA的产量取决于标本的起始量,每毫克组织总RNA的产量大约为4~7mg,每106个细胞大约为5~10mg。但该法不适合从富含甘油三酯的脂肪组织中提取RNA,而且有时RNA会带有多糖和蛋白多糖的污染,这些污染将影响乙醇沉淀后RNA的溶解,同时抑制RT-PCR反应,并通过结合到膜上而影响RNA杂交