核酸的分离与纯化_百替生物(15)
发布时间:2021-06-05
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中的印迹步骤。脂肪组织RNA的提取可换用(异)硫氰酸胍-CsCl超速离心法。当多糖与蛋白多糖的污染比较严重时,可下一个方法,通过增加一个有机溶剂的抽提步骤并改变RNA的沉淀条件而加以消除。
(二)可同时制备RNA、DNA与蛋白质的一步法
该法是(异)硫氰酸胍-酚氯仿一步法的改进方法。它是以(异)硫氰酸胍-酚的单相裂解试剂裂解细胞,然后加入氯仿后形成两相。变性的DNA与蛋白质位于两相的界面,保留于上层水相的RNA在RNA沉淀溶液中通过异丙醇沉淀与75%的乙醇洗涤进行制备。其中RNA沉淀溶液的成分为1.2mmol/L的NaCl与0.8mmol/L的柠檬酸二钠。由于RNA沉淀溶液的使用,该法制备的RNA样品极少有多糖与蛋白多糖的污染,可用于mRNA的纯化、Northern杂交、逆转录和RT-PCR反应等。处于界面的DNA与蛋白质可通过乙醇和异丙醇分别分级沉淀出来。该法制备的DNA,大小约为20kb,可作PCR反应的模板,蛋白质样品则主要用于免疫印迹。目前,该法已有多种商品化的单相裂解试剂供选择,是最常用的总RNA提取法,其产率与(异)硫氰酸胍-酚氯仿一步法相当。
(三)其它方法
RNA的分离纯化方法与方案还有许多,如(异)硫氰酸胍-CsCl超速离心法、盐酸胍-有机溶剂法、LiCl-尿素法、热酚法等,因各种原因目前已较少使用。
三、mRNA的分离与纯化
与大小和序列明确的rRNA、tRNA及核内小分子RNA不同,真核生物的mRNA在细胞中含量少、种类多、分子量大小不一。除血红蛋白及某些组蛋白外,绝大多数mRNA在其3'末端带有一个长短不一的多聚腺苷酸(polyadenylic acid)的结构,即poly(A)尾巴。以总RNA制品为起始材料,利用核酸的碱基配对原理,通过oligo(dT)-纤维素或poly(U)-琼脂糖凝胶的亲和层析,可以很容易地同时分离不同种类与大小的mRNA的分子群体。理论上,它们可编码细胞内所有的蛋白质与多肽分子。
(一)oligo(dT)-纤维素柱层析法
oligo(dT)-纤维素柱层析法是mRNA制备的一个标准方法。它是以oligo(dT)-纤维素填充层析柱,加入待分离的总RNA样品,其中poly(A)+RNA在高盐条件下,通过碱基互补,