Primer Premier 5.0中文使用说明书

以设置蛋白序列比较结果的空隙罚分参数该选项仅在蛋白序列比较中可用

更多信息

如果您想得到关于设置参数和ClustalW法则的更多信息请从以下网址获取由原作者提供的完整文件www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/ClustalW/clustalw.html

序列翻译

激活序列

在GeneTank窗口的一个列表框内显示了原始序列以及由它翻译出的其他序列产生翻译序列的机制如下Translated DNA从原始的蛋白序列推导DNA

序列

由蛋白序列反推出的DNA序列或由原始DNA

翻译出蛋白序列再

Translated Protein从原始DNA翻译而成蛋白序列或原始蛋白序列翻译出DNA

序列再由DNA序列反推出蛋白序列

推导DNA按钮

当前序列为原始或推导DNA时该按钮不可用当前序列为蛋白序列时点击该按钮将会激活一个Codon Table Selection窗口您可以选择密码子列表和阅读框架翻译结果中的多义碱基请参照说明书的附录可选操作

Translate > To DNA

翻译蛋白质按钮当前序列为原始或推导蛋白序列时该按钮不可用当前序列为DNA序列时点击该按钮同样将会激活Codon Table Selection窗口您可以选择密码子列表和阅读框架如果原序列中存在的多义碱基使密码子无法翻译成为蛋白残基该残基位点会用*号代替可选操作

Translate > To Protein

Edit Codon Table窗口

使用这一窗口

您可以创造新的密码子列表删除或编辑已有的密码子列表但PRIMERPREMIER 提供的标准密码子列表是不能编辑的

使用

ADD按钮创建新的密码子列表会使用标准列表并初始命名为<New Organism 某一数字>使用Edit Codon Table Name

对