2期王琳等院鲁棉研15号纤维品质性状QTL定位研究99

化科技有限公司遥

连锁分析与QTL位点系统命名

应用SPSS16.0软件对纤维品质性状检测结果进行统计分析袁用卡方检验分析标记在群体上是否符合孟德尔分离规律遥使用JoinMap3.0构建遗传连锁图谱袁最大遗传距离为50cM袁LOD值逸7.0遥对照前人[14,16,22-25]构建的遗传连锁图谱将连锁群定位到相应的染色体袁利用绘图软件MapChart2.2绘制遗传连锁图袁将无法定位的连锁群定义为LGXX袁其中LG代表野连锁群冶袁XX表示序号遥应用WinQTLCart2.5的复合区间作图法进行单位点QTL定位[26]袁对于不同环境条件下位

不同环境下麦克隆值和伸长率平均值的差异较大袁可能是由于鲁棉研15号是黄河流域的品种袁在长江流域受环境条件的影响发生较大变异遥3个亚群体纤维品质各性状偏度均小于1袁符合典型的数量性状正态分布特征遥3个亚群体在6个环境条件下纤维长度和纤维强度均低于高值亲本613袁也证明了613的纤维品质确实优良遥

纤维品质性状QTL定位及分析

利用WinQTLCart2.5的复合区间作图法袁通过对3个亚群体进行纤维品质性状的QTL作图袁共检测到46个纤维品质性状相关的QTL袁其中纤维长度16个袁纤维强度7个袁麦克隆值12个袁伸长率6个袁整齐度指数5个袁见图1和表2所示遥

共检测到16个纤维长度的

QTL袁解释1.41%~24.28%的表型变异渊贡献率冤遥其中qFL-4-1能够在C亚群体的两个环境中同时检测到袁位于相同的标记区间内袁解释表型变异分别为7.48%尧10.53%遥qFL-4-3能够在3个亚群体的4个环境中同时检测到袁均位于DPL0133-NAU1369区间内袁并且在连锁群上的位置相同袁平均解释13.93%的表型变异遥qFL-4-4能够在3个亚群体的4个环境中同时检测到袁均位于NAU4064-COT065区间内袁平均解释14.94%的表型变异遥这3个QTL是能够稳定遗传的袁其余的QTL只能在同一个亚群体的一个环境中检测到遥控制纤维长度的QTL中袁除了位于LG3和LG11连锁群上的QTL的增效基因来自R55外袁其他连锁群上的QTL的增效基因均来自613袁这也说明父本材料613的纤维长度性状比较优良袁与表型性状的结果一致遥

共检测到7个纤维强度的

于同一连锁群渊染色体冤上的控制相同性状的QTL的确定袁采用置信区间为峰值两侧各下降1LOD值所对应的区间袁在此区间之内发生重叠的

QTL即为相同的QTL[13]遥选用1000次排序测验值2.5遥

渊Permutationtest冤袁LR值取值11.5袁相当于LOD

染色体命名采用染色体亚组+种名+染色

体序号的方法袁例如Ah03表示陆地棉A亚组3号染色体遥QTL的命名方法采用水稻上常用的方法袁按照QTL+性状+染色体渊连锁群冤+QTL个数袁其中QTL以小写野q冶开始袁性状以英文缩写表示袁如果同一染色体渊连锁群冤上存在多个不同野3冶等表示遥

位点的QTL则在染色体后面加上数字野1冶袁野2冶袁

结果与分析

SSR多态性分析和遗传连锁图谱构建利用亲本进行SSR引物筛选共得到151对多态性引物袁产生154个多态性位点遥利用其中的116个位点构建了25个连锁群袁共覆盖892.25cM袁约占棉花总基因组的20.05%遥最大的连锁群有16个标记袁最小的只有2个标记袁每个连锁群平均包含4.64个标记袁标记间平均距离为7.76cM遥25个连锁群中的19个与染色体建立了联系袁其余6个连锁群未定位到染色体上

遥

纤维品质性状的表现

纤维品质性状表现见表1遥对于不同的亚群体袁在不同环境条件下纤维品质性状的平均值稍有差别袁但变异幅度不大遥其中亚群体B和C在

QTL袁这些QTL只能在同一个亚群体的一个环境中检测到袁解释表型变异的1.50%~10.89%遥除了qFS-4-2的增效基因来自R55外袁其他QTL的增效基因均来自613遥

共检测到12个麦克隆值的

QTL袁解释表型变异的2.96%~14.22%遥其中qFM-11-1能够在两个亚群体的2个环境中同时检测到袁都位于BNL1421-CIR096的区间内袁解释的表型变异分别为14.22%尧4.43%遥其余的