背景：传统的HLA测序分型技术都是对父系母系双倍体进行扩增,由于HLA多样性高,产生了大量的模棱两可难题,而采用基于组特异性单倍体全长测序分型方法来解决模棱两可结果的确认定型鲜有报道。目的：分析基于组特异性单倍体全长测序分型方法对HLA基因分型模棱两可结果准确定型的效果。方法：对2例模棱两可结果标本以低分辨率分型方法结果作为参考起点,通过组特异性扩增分离,基于等位基因全长单倍体的Sanger测序(PCR-SBT)分型。

王宋兴，等. 基于HLA 组特异性单倍体全长测序方法对模棱两可结果的准确定型 P .O. Box 10002, Shenyang 110180

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Exon1 18 A*11:01:01:01 CGGTCGCTCT TCTAAAGTCC GCACGCACCC ACCGGGACTC AGATTCTCCC CAGACCCCGA GGATGGCCGT CATGGCGCCC A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Intron1 98 A*11:01:01:01 CGAACCCTCC TCCTGCTACT CTCGGGGGCC CTGGCCCTGA CCCAGACCTG GGCGGGTGAG TGCGGGGTCG GGAGGGAAAC A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 178 A*11:01:01:01 CGCCTCTGCG GGGAGAAGCA AGGGGCCCTC CTGGCGGGGG CGCAGGACCG GGGGAGCCGC GCCGGGAGGA GGGTCGGGCA A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Exon2 258 A*11:01:01:01 GGTCTCAGCC ACTGCTCGCC CCCAGGCTCC CACTCCATGA GGTATTTCTA CACCTCCGTG TCCCGGCCCG GCCGCGGGGA A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 338 A*11:01:01:01 GCCCCGCTTC ATCGCCGTGG GCTACGTGGA CGACACGCAG TTCGTGCGGT TCGACAGCGA CGCCGCGAGC CAGAGGATGG A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 418 A*11:01:01:01 AGCCGCGGGC GCCGTGGATA GAGCAGGAGG GGCCGGAGTA TTGGGACCAG GAGACACGGA ATGTGAAGGC CCAGTCACAG A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Intron2 498 A*11:01:01:01 ACTGACCGAG TGGACCTGGG GACCCTGCGC GGCTACTACA ACCAGAGCGA GGACGGTGAG TGACCCCGGC CCGGGGCGCA A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 578 A*11:01:01:01 GGTCACGACC CCTCATCCCC CACGGACGGG CCAGGTGGCC CACAGTCTCC GGGTCCGAGA TCCACCCCGA AGCCGCGGGA A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 658 A*11:01:01:01 CCCCGAGACC CTTGCCCCGG GAGAGGCCCA GGCGCCTTTA CCCGGTTTCA TTTTCAGTTT AGGCCAAAAA TCCCCCCGGG A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Exon3 738 A*11:01:01:01 TTGGTCGGGG CCGGGCAGGG CTTGGGGGAC TGGGCTGACC GCGGGGTCGG GGCCAGGTTC TCACACCATC CAGATAATGT A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 818 A*11:01:01:01 ATGGCTGCGA CGTGGGGCCG GACGGGCGCT TCCTCCGCGG GTACCGGCAG GACGCCTACG ACGGCAAGGA TTACATCGCC A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------T- 898 A*11:01:01:01 CTGAACGAGG ACCTGCGCTC TTGGACCGCG GCGGACATGG CAGCTCAGAT CACCAAGCGC AAGTGGGAGG CGGCCCATGC A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 978 A*11:01:01:01 GGCGGAGCAG CAGAGAGCCT ACCTGGAGGG CCGGTGCGTG GAGTGGCTCC GCAGATACCT GGAGAACGGG AAGGAGACGC A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Intron3 1058 A*11:01:01:01 TGCAGCGCAC GGGTACCAGG GGCCACGGGG CGCCTCCCTG ATCGCCTATA GATCTCCCGG GCTGGCCTCC CACAAGGAGG A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1138 A*11:01:01:01 GGAGACAATT GGGACCAACA CTAGAATATC ACCCTCCCTC TGGTCCTGAG GGAGAGGAAT CCTCCTGGGT TTCCAGATCC A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1218 A*11:01:01:01 TGTACCAGAG AGTGACTCTG AGGTTCCGCC CTGCTCTCTG ACACAATTAA GGGATAAAAT CTCTGAAGGA GTGACGGGAA A*11:01:01:01NEW ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1298 A*11:01:01:01 GACGATCCCT CGA …… 此处隐藏：16006字，全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……