猫白介素-18基因的分子克隆、序列分析及其表达(3)
发布时间:2021-06-08
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根据GenBank中报道的猫白介素-18基因(IL-18)序列,对用ConA刺激的实验猫外周血单核细胞(PBMCf)进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR产物纯化后克隆入pMD18-T中得到重组质粒pTIL-18,进行核苷酸序列测定,并与不同物种的IL-18基因进行了序列比较。结果该基因全长579bp,编码1
200农 业 生 物 技 术 学 报 2007 年
均为 100%。用 SignalIP 软件分析表明, 在推导的猫
氨基酸序列中没有信号肽; PROSITE 软件分 析, 也没有发现潜在的 N 联糖基化位点, 但存在 4 个 Cys 残基, 推测可能会形成二硫键结构。在氨基 酸序列比较时,发现猫
分子上存在有
分
即 phex(12)phexserx 子类似的特征性序列结构,
和推导的氨基酸序列的同源性分布为 89.8%、
88.6% 、 88.4% 、 88.1% 和 90.6% 、 88.9% 、 85.2% 、
但与小鼠 的差异较大, 核苷酸的同源 84.9%;
性在 66.1%左右,推导的氨基酸序列的同源性为 与鸡 66.5%; 约为 30.1%。
的差异很大, 核苷酸序列同源性
(6)pheleu( x 代表相对变化的氨基酸)
。 图1.Fig.1.AmplificationofM, DL15000+2000 1, negativecontrol 2and3, feline
gene.
图 2. 重组质粒 pET的酶切鉴定
Fig.2.Identificationofrecombinantbyenzyme
digestion
M,DL15000+2000 1and3,nonrecombinant玉
芋;
2,4,5and6,recombinant玉芋.
2.4 猫 IL18 成熟蛋白氨基酸序列二级结构与三级 结构预测
用 HNN软件对猫 IL18 二级结构预测表明, 猫
IL18分子包括 3 段 琢 螺旋,中间由无规则圈曲相
连接 (图 3); 用 Swissmodel 软件进行三级结构预测 表明,猫 IL18 三级结构是由无规圈曲连接的多段 平行的 琢 螺旋所形成中空状的桶样结构 (图 4)。 2.5 不同物种 基因的遗传进化分析
序列分析表明, 猫
基因与犬、 羊、 牛和猪
等哺乳动物的
同源性相对较高(图 5), 核苷酸
图3.猫 IL18二级结构分析
Fig.3.Thesecondstructureanalysisoffeline
IL18by
hierarchicalneuralnetwork(HNN)method
图4.猫 IL18氨基酸序列 3D结构分析
Fig.4.3DstructureanalysisoffelineIL18aminoacidsequence
2.6 的构建
以重组质粒 pET为模板, PCR 可扩增出
目的基因片段(图 6); pET用
芋与预期结果相一致, 双酶切,
可得到 5369表明该重组质粒构建正确。 和 579bp2 个片段 玉(图 和 7),
2.7 猫
基因在
中的表达及其检测
经 SDSPAGE 分析, pET转化菌的诱导产
物在约 27.5kD处有 1 条特异的蛋白带(图 8 箭头 处), 与预期值大小相符; 而 pET28a(+)转化菌的诱 导产物和 pET
转化菌的非诱导产物在该处没