2003年中日贸易额达到1335.6亿美元，日本对华投资实际到位达51.42亿美元。日本是中国的第一大贸易伙伴国，中国是日本的第二大贸易对象国，是韩国的第一大出口对象国和第三大贸易伙伴国。俄国为中国的第八大贸易伙伴，中国为俄罗斯的第六大贸易伙伴。

二是经贸关系的良好发展势头与整体区域合作的停滞不前形成了鲜明的反差。由于东北亚地区存在明显的差异性，各国对东北亚区域经济合作的态度、参与程度也不一致，特别是日本，长期以来一直对东北亚区域合作十分冷淡，只有日本海沿岸的地方政府有一定的积极性。因此，东北亚区域合作至今没有形成制度化的合作机制。推进东北亚区域经济合作的主体不是国家或中央政府，而是地方政府、民间组织和企业，国家层面的多边合作机制尚未建立起来。

制约东北亚区域合作发展的因素包括地区多样性、发展水平差距等方面，但一些深层次的矛盾才是根本性的障碍，特别是近年来中日之间一些深层次矛盾逐渐浮出水面。

一是领海、领土争端日益突出。我国与日本关于钓鱼岛主权之争尚未解决，而且最近一个时期，我国与日本东海划界和资源开发的矛盾也逐渐凸现出来。

二是美日、美韩军事同盟关系与我国实现祖国统一的矛盾。美日、美韩同盟是日本和韩国外交的基轴，美国干涉我国台湾事务并插手朝鲜半岛。如果台湾当局一意孤行，我国将被迫使用武力实现国家统一，美国的介入意味着把日本和韩国拖入与中国的直接对抗之中。因此，我国与日韩之间存在着因台湾问题而爆发直接冲突甚至战争的可能性，这一根本性的矛盾是制约东北亚区域合作向前发展的主要障碍。