总RNA的提取定量与RT-PCR(4)
时间:2025-07-12
时间:2025-07-12
南医实验报告
(二)RT-PCR
1. 总RNA的提取:见前述内容。
2. cDNA第一链的合成:目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以TAKARA公司提供的PrimeScriptTM 1st Strand cDNA Synthesis Kit试剂盒为例。 (1)在0.2ml微量离心管中,加入以下:
总RNA 1-5 μg 、dNTP 1 μl 、Random primer 1 μl 、补充适量的DEPC H2O使总体积达10 μl。轻轻混匀、离心。
(2)PCR仪上65℃加热5min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。 (3)然后加入下列试剂的混合物:
5×PrimeScript buffer 4 μl 、RNase inhibator 0.5 μl 、RTase 1 μl 、RNase free H2O 4.5 μl , 轻轻混匀,离心.
(4) 30℃孵育10 min。 (5) 42℃孵育60 min。
(6)于70℃加热15 min以终止反应,将管插入冰中。
3.PCR:[本次实验采用Premix Taq Version2.0(Loading dye mix)试剂]
(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:第一链cDNA 2 μl 、上游引物(10pmol/L)2 μl 、下游引物(10pmol/L)2 μl 、dNTP(2mmol/L) 4 μl 、10×PCR buffer 5 μl 、Taq酶(2U/μl) 1 μl 。 (2)加入适量的ddH2O,使总体积达50 μl。轻轻混匀,离心。
(3)设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G-3-PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。 (4)电泳鉴定:进行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。 (5)结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带扫描分析。
四、实验注意事项
1、本实验大部分为RNA操作,注意RNA酶的污染。
2、快速的操作,低温环境,少量取上清 主要是抽提之后吸取上清时要特别小心,只要不把蛋白层吸出来就不会有RNase污染。
3、加样原则是酶最后加,其他试剂按照体积大小从大往小的加。
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