砧用南瓜种质资源形态学性状与SSR标记分析(8)
发布时间:2021-06-08
发布时间:2021-06-08
1386 园 艺 学 报 41卷 续表4
SSR引物 序列 Sequence 编号
No. SSR primer 正向引物 Forward primer(5′–3′) 反向引物 Reverse primer(5′–3′)
17 CMTp263 CAGGCTATTCGCACCCTCTA CCTCATGCATTTTGCGTGTA 5 0.56
18 CMTm5 TTTCTCGAGCCTCAC ATGGACAATTTGGATATTA 5 0.95
19 CMTm11 TGGAAGGATTCTCCCACAGT TACAATTTGACGTCCGCAAG 8 1.18
20 CMTm19 GCATGGGAGATGAAGGTTAG ATTTCCTGGTGGTATGAGATTC 5 0.72
21 CMTm20 GTGGGCCATATCGATTCACT CGAAAGTCGCAGAGAACACA 5 0.79
22 CMTm50 CAGTGTTCCTCTCCCCATTC TCGGACTCTGAACTTGACCA 3 0.43
23 CMTm62 AGTGAGGGAGGCGACAACT GAACGTGTCCATGTCATTGC 3 0.32
24 CMTm63 GCAGAAGATACCGTCGGAGT AAGGTGAACGGGAATGTGAG 8 0.63
25 CMTm66 ACGCGTTGTTGTTAGTGTGG GGGGATTTATGAACCCAACAT 3 0.51
26 CMTm90 TGAAGCATTAAAAATGGGTGTG ACACATTGCCCACTAATTCTAGG 5 0.84
27 CMTm121 CCCAAATTCAAAAGAAAATC CCAGTTAAATCAGACCGAAT 3 0.44
28 CMTm133 CGACGTATGATCGAGCCTCT TGCTAAGCCGTTGTCATCTCT 4 0.60
29 CMTm144 ACATGGGCATACCTCGAATC CACCTGGCTGTTTTGTCTGA 3 0.29
30 CMTm158 CCCAGCTATGAAGGTCTCTG AAAAGCACAAAAGAAACACCA 5 0.82
31 CMTm165 TTCCAGACCCAATTCCCTTA TCCATGGAGATGGGAGGTAG 5 0.97
32 CMTm170 TCAGACCCACTCCCATGAAC AGCGAACACGTGAAAACGTC 5 0.97
33 CMTm181 CCCTTAAGGTCTCGCAGCTT TATTAGGCGGACGGACAGG 2 0.60
34 CMTm183 CTTTGCATTGCCACTCTTCT TGAGGGAAATTGAATGTGGT 4 0.68
35 CMTm209 ATTAGAATCCCTTGGAGAACG GCAATCGTTTTTCTGTTGGT 6 0.59
36 CMTm214 TGCTTTGATCAGTGAGCAGT GGATGTACTCTCCGGACTTTC 4 0.56
37 CMTm221 CAATAAGATAGCTCTCACGTTGC TGCCTAGTTATCGCGACTTC 2 0.43
38 CMTm248 TGATCATGAAAGGGGGAGAG CCACTTCAAGCTTGCCTTCT 4 0.34
39 CMTmC1 AACGTCCTTACTGGCACACC TTCCACAAGTTGTTTTGGTCAC 5 0.85
40 CMTmC30 TCAAACACTTTCTTTGGAAGGA TTTCATTGAACTGGGTCAAGCG 2 0.24 多态带数 多样性指数 Polymorphic fragments H ’
图1 引物CMTm11在47份砧用南瓜材料上的PCR扩增图
Fig. 1 PCR amplification profile in 47 varieties by primer CMTm11 in rootstock-used pumpkins
2.3 聚类分析
依据欧式距离,对47份砧用南瓜种质资源的所有形态学性状进行UPGMA聚类分析,绘制聚
类树状图(图2)。当阈值为1.02时,47份材料划分为4个类群。其中,第Ⅰ类群中包含了大部分 的品种,共有40份种质,占85.11%;类群Ⅱ只有1个品种(34号);第Ⅲ类群中有4个品种,分
别为2、7、30、44号材料;类群Ⅳ中为12和47号材料。类群Ⅰ全部为中国南瓜,类群Ⅱ和Ⅲ为白 籽南瓜,类群Ⅳ为黑籽南瓜。在4个类群中,根据对形态性状的测量和观察(具体数据未列出),类 群Ⅰ种子均无光泽、多数质量较轻,能结实,植株长势中等;类群Ⅱ种子白色、有光泽,能结实, 植株长势较强;类群Ⅲ种子均为白色、有光泽,雄蕊败育,未结实,植株长势较强;类群Ⅳ少雌花, 结实率极低,植株长势前期强后期弱。在3个类型的南瓜中,白籽南瓜(类群Ⅱ、Ⅲ)的植株长势