基因芯片及其在突变检测中的应用1

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54 第1 8卷第1期

学研究医学生报 J our n al fo M e idc a l Po s gtr d u a at esV 1 0. 18 No 1

.20 05年 1月

Jan . 2 005

综述

基因片及其在突变检测中的芯用李应恒金,冰综述陈 (南京区军京南医院总临药床科理,苏江京 2 1南 0 00 2)摘要:基因片芯技是近年术起兴的一项重要生物的技。术作者绍介基了因芯片的起源、发展及其基本操作,并介绍了铺瓦阵式列、接等直位因特异基荧性检测法、光辅助核苷酸寡链、连接酶检反应测、肽核酸技术等几不同种芯技片在术变突测中的应检用,并探讨了基因片芯技术在合理用药的应中前用景。 键关词:基因片芯突;检变测;合理用药中分图号类 R: 9 6 5 2 文献.标码识: A 文章编号: 1 00 -8 81 9 ( 290 0 5 ) 0 1 - 0 50 4 0-5

Ge ne c h pi a nd i t u s se i tn e h e tde c t oi n o f u mta t i n osL I Ji n —h e gn,C HEN Bi n r eg v i e iwn g (D ep a rtm en t o f C l i ni c la P h r amac o l og y, N a n i n g Gje n e a r l H o s p i tal o f N a n ji g n i l M ita r y C om ma n, Pd L,A aN n j i ng 2 1 0 002, iJ an gsu C,h i n a ) bAs t r a c: t Ge n e c h i p is a n i m po ̄a n t b io l o gi cal t e c h no l o gy wh i,c h is de e v l poi n g q u c ki l r e cye n t y lI.n

hti s a r t i c l e, ew e rv ie wed t h e o r i g n,id e evl o pemn t, ba si c o pe r a ti o n of g e ne c h i p. e vS r ae l k i nd so f e n ge

hc ip s i nc l d iu n gti l e d a

r ray 。d i r e t c la le le ps cei if c f ulo e rs ecn c e t arg e t i n(gD A FTa r r) a y l a,b e l e d aux il iar o ly i g on uc l e o tid es a r y,lai g a s e d e t e c ti o n re cat i on a ra,a nyd p p te i de n u lc ei c aci d ar ay we er in t ro d c u d e sa e xam lp es fo r t h ei r u s e i n u mt a t ion ed te ct o ni. T e h p ro s p ec t o f th e u se of g ene c hi p i n op t i i m zi n g r u d g t h e r— pay w a s sl oa i s d u scs e d. Ke y w ord : G e s en h cip; M ut a t i o nd e t ce t oin ; O pt miiz i gn d g ur h ter a py

0引

言阵列芯片或寡核苷聚酸 芯,是片生物芯片的 种一¨ 。因芯片采基大用量特定寡的核苷片酸段或基因段作为片探,针有规律地列排固定于玻璃或尼

基因片技芯术对是DN A交、杂分型测序技和术等传统物技术生的重创新和大飞跃。由基于因芯片 用微采电子学的并处行理高密度和集的概念成,具龙基底等持物支上,成二形阵维列,待测与标记的样品的基因按基配对原理进行碱杂交,从检而测特定因基。

有高效、高息量信等突出优点这。项术技的出现虽仅短短几年, 已但受到泛广重视。1基因芯的片概念发展和概

况 2多0前, S年 u toh e r n 发经现过记标核的分酸子用于可检结测在固相支合持上物的核酸,次引入首克了隆杂与交号间信一对一的映关。2系0世纪 08年代期中,有人将聚八核苷酸寡针固定探尼龙

基因在芯片 (g e n e c h i )又p称D N芯片A、D NA微

收稿 E t期:2 0 40 - 0-8 -24;修订期日: 2 00 . 140 . 25 金项目基:家国自科然基金学助资目(批准项号: 30 4 7 20 5 )5

者简介:李金 ( 1恒 5 1一 9 ),男,江苏阴淮人,任药主师,医学博士,从事临床药理专学。业

普资维讯htp://第 1

李期恒金,等

基因片及芯其在变突测检中的用应

5 5

膜上进行杂 测交序。]随无孔固着相支持物的使用和高度寡密核苷酸合成的这两项关技键术开展的出,现了正意真义上的基因芯片。1 9 8年 8,B ai n s 等将短的 D NA片段固定至持支物上,反以杂向交

合要设理异置核种酸行实验平、酸质核量测对照检、封闭对照、归整对照,化以保证结果准确性和的重复。性

2 . 2 . 3像分析常成用的芯成像分片析统系激有光聚焦扫共仪和描电荷合耦 (C C )扫描D。仪前者的激光光可产源生激发不同光荧料染的光当。探针的式方行进列序测定2 0世纪。90年代,美国 M f y — e t mi rx公实司现 D了 N探针A子分的高密度成集,通与样过的杂品反交应获取其酸序核信列息j当。今,随着生命学科众与多相关学科 如计(算机学、科材料科学、微加工技术、有机合成技等术 )的猛迅发,为生展芯片的实现提供了物践上的实可能性微。

与待测核完酸正全配对常时荧光信的强度是号有具单个或 2个错碱配基针探的 5 3~倍 5而且,荧信光号的度还强样品中与分靶的子含量一定的线性关呈系。C C扫描D仪图将分像成若干块,测小定每小个块中平均的荧光度强,而进求阵列中个点每相的对光强度荧通,计过机算理处获得结果还。有人自己型列阵术由于技采取玻片和璃片硅等体载, 而使从芯片用达能到正的平行实真验、微化、型多复用路和

动化。自这些点特使,能其进够行早期术所技不完能成的些一用应。基因芯片2的制备和基本作操 2 .1基因芯片的制 备 。基因片的制芯作过程包

设计或用利已有的共聚焦微显镜、光显微镜等改荧装芯为片描装扫。置 C e uhn g等自行计构建设了激光扫描仪可,同时定双测荧色光料标记染的物生芯片。

以下括个几骤步:探针①设计的与成;合②芯片支撑物的处理;③ D N阵列A点印;芯片④后理处,包括重新水化及干燥合、 u V一交联、闭封及性变;⑤芯片质量检测几个。步骤最关键中的是 D A微阵列N的点印,前目分为种两主要

类型:原位成合( i n s it u sy —n …… 此处隐藏:12165字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……

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