广西普通野生稻的遗传多样性及分布特征(5)
时间:2026-01-15
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8期 黄 娟等:广西普通野生稻的遗传多样性及分布特征 2637
基因数(Ae)最高为12.73(RM257),最低为1.51(RM277);总遗传多样度(Ht)变化为0.92(RM257)~0.34(RM277),平均0.74;居群内遗传多样度(Hs)变化为0.56(RM72)~0.17(RM115),平均0.38;居群间遗传多样度(Dst)变化0.16(RM227)~0.52(RM154),平均0.36;基因分化系数(Gst)变化0.70(RM115)~0.34(RM321),平均0.49。 Ht的平均值达到0.74,说明总的遗传变异明显,但Hs与Gst的平均值很接近,前者为0.38,后者为0.36,说明两者对总遗传变异的贡献相当。Gst的均值0.49,说明49%的变异发生在居群间。盖红梅[8]、杨庆文[24]等报道遗传变异主要发生在居群内,而本实验
表3 不同居群SSR遗传多样性检测
由于材料来自不同地区,居群间存在较大差异,居群间的变异就显得比较明显。
香农指数(I)变化范围从0.64(RM277)~2.62(RM304),说明不同检测位点对多样性的影响不同,在供试个体中分配的均匀性和多样性也不一样。 2.2 居群间遗传多样性的比较
将SSR检测结果按居群进行分析,得到27个居群的平均等位基因数、平均有效等位基因数、期望杂合度、实际杂合度、固定指数和香农指数等参数,列入表3。从表3可以看出27个居群SSR标记的多样性状况。结果表明,平均等位基因数(A)从1.44(P20)~4.56(P21);平均有效等位基因数(Ae)从1.31(P16)~
Table 3 Genetic diversity among populations based on microsatellite loci
居群 Pop.
等位基因数
A
等位基因有效数目
Ae
预期杂合度
He
实际杂合度
Ho
固定指数
F
香农指数
I
P1 2.17 1.84 0.40 0.57 -0.42 0.62 P2 3.20 1.96 0.44 0.70 -0.57 0.71 P3 2.53 1.86 0.42 0.57 -0.34 0.66 P4 3.61 2.58 0.58 0.69 -0.18 1.00 P5 3.33 2.05 0.44 0.62 -0.40 0.74 P6 3.56 2.38 0.53 0.60 -0.13 0.93 P7 2.39 1.74 0.37 0.63 -0.71 0.55 P8 2.69 1.67 0.33 0.54 -0.65 0.52 P9 1.64 1.51 0.26 0.50 -0.92 0.36 P10 3.28 1.67 0.34 0.53 -0.57 0.56 P11 2.44 1.90 0.40 0.59 -0.46 0.64 P12 3.06 1.93 0.40 0.51 -0.26 0.69 P13 3.25 1.97 0.43 0.47 -0.09 0.71 P14 2.00 1.49 0.25 0.42 -0.69 0.38 P15 4.39 2.57 0.52 0.42 0.20 0.99 P16 1.56 1.31 0.16 0.20 -0.20 0.24 P17 2.19 1.50 0.28 0.26 0.08 0.45 P18 1.61 1.53 0.27 0.49 -0.81 0.37 P19 2.36 1.61 0.29 0.35 -0.20 0.48 P20 1.44 1.41 0.22 0.40 -0.84 0.29 P21 4.56 2.89 0.56 0.46 0.18 1.06 P22 2.92 1.86 0.37 0.34 0.08 0.64 P23 3.33 2.07 0.44 0.40 0.08 0.77 P24 3.14 2.18 0.48 0.58 -0.22 0.81 P25 3.14 2.25 0.48 0.34 0.30 0.82 P26 2.44 1.78 0.38 0.39 -0.03 0.59 P27 1.94 1.77 0.37 0.53 -0.42 0.55 平均Mean 2.75
1.90
0.39
0.48
-0.30
0.63
He: Expected heterozygosity; Ho: Observed heterozygosity; F: Fixation index. The same as below
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