广西普通野生稻的遗传多样性及分布特征(4)

2636 中 国 农 业 科 学 42卷

其中HT为总居群基因多样度，HS为居群内基因多样度以上数据通过POPGENE 1.31软件和Excel直接计算得到；聚类分析通过NTSYS 2.10软件进行。

利用36对SSR引物对所有个体材料检测后，将得到的等位基因数、有效等位基因数、总遗传多样度、居群间和居群内遗传多样度、基因分化系数以及香农指数等参数列入表2。从表2可以看到，36个微卫星位点中等位基因数（A）最高为21（RM72），最低为4（RM277，RM321，RM321，RM313）；有效等位

2 数据分析

2.1 总居群微卫星多态位点及遗传结构度量

表2 不同SSR引物的遗传相关参数

Table 2 Related parameters of different SSR loci

位点 Loci

染色体 等位基因数 Chromosome A

10 5 4 12 11 7 15 10 15 16 7 14 5 19 4 8 18 8 12 6 13 11 7 4 7 17 6 8 9 8 5 10 7 9.86

等位基因有效数目

Ae

4.27 3.45 1.51 6.54 4.67 3.46 7.81 2.99 7.20 12.73 2.67 10.91 2.32 2.43 11.02 2.06 3.98 7.81 2.50 6.34 4.40 5.67 10.02 5.41 3.73 2.69 3.17 3.85 1.76 3.74 2.78 3.20 5.84 2.34 6.88 3.55 5.05

总遗传多样度

Ht

居群内遗传多样度

Hs

0.41 0.31 0.17 0.48 0.46 0.27 0.38 0.36 0.38 0.49 0.37 0.39 0.17

居群间遗传多样度 基因分化系数香农指数

Dst Gst I

0.36 0.40 0.16 0.37 0.33 0.44 0.50 0.31 0.48 0.43 0.26 0.52 0.40 0.25 0.52 0.17 0.46 0.47 0.30 0.38 0.43 0.30 0.34 0.39 0.38 0.18 0.19 0.34 0.36 0.41 0.33 0.43 0.44 0.33 0.44 0.26 0.36

0.46 1.72 0.57 1.41 0.48 0.64 0.44 2.10 0.42 1.84 0.62 1.48 0.57 2.21 0.46 1.50 0.55 2.20 0.46 2.63 0.42 1.22 0.57 2.49 0.70 1.06 0.42 1.09 0.58 2.62 0.34 0.93 0.61 1.64 0.54 2.33 0.50 1.31 0.45 2.08 0.55 1.57 0.37 2.09 0.38 2.53 0.48 1.85 0.52 1.46 0.29 1.17 0.27 1.50 0.46 1.97 0.41 2.18 0.55 1.47 0.52 1.36 0.63 1.47 0.53 1.86 0.57 1.06 0.51 2.08 0.37 1.51 0.49

1.71

RM152 8 RM120 11 RM277 12 RM161 5 RM349 4 RM337 8 RM216 10 RM282 3 RM254 11 RM257 9 RM129 1 RM154 2 RM115 6 RM304 10 RM321 9 RM104 1 RM240 2 RM173 5 RM297 1 RM118 7 RM287 11 RM212 1 RM305 5 RM313 12 RM345 6 RM320 7 RM347 3 RM23 1 RM271 10 RM252 4 RM242 9 RM264 8 RM131 4 平均Mean

0.77 0.71 0.34 0.85 0.79 0.71 0.87 0.67 0.86 0.92 0.62 0.91 0.57 0.59 0.91 0.51 0.75 0.87 0.60 0.84 0.77 0.82 0.90 0.81 0.73 0.63 0.68 0.74 0.87 0.73 0.64 0.69 0.83 0.57 0.85 0.72 0.74

RM6 2 6 0.34 0.38 0.34 0.29 0.40 0.30 0.46 0.34 0.52 0.56 0.42 0.35 0.45 0.50 0.40 0.51 0.33 0.31 0.26 0.39 0.24 0.42 0.45 0.38

RM72 8 21

RM7 3 11

A: The number of alleles per locus; Ae: The effective number of alleles per locus; Ht: Total genetic diversity; Hs: Genetic diversity within populations; Dst:

Genetic diversity among populations, Gst: The coefficient of genetic differentiation, I: Shannon’s information index. The same as below