SRAP分子标记在园林植物遗传育种中的应用(2)
发布时间:2021-06-05
发布时间:2021-06-05
致内含子、启动子和间隔序列不同进而产生多态性。1.1SRAP的引物特点
SRAP技术的基本原理是通过一对引物对ORFprimer)长17bp,5'端进行扩增。其中正向引物(F-的核心序列为14bp,由10bp无任何特异的填充序
[3]
列(一般是TGAGTCCAAA,少数为TGAGTCCTTT)和CCGG组成,随后为3'端的3个选择性碱基,选择
RAPD、AFLP和SSR等标记技术比较,的RFLP、
SRAP具有适用范围广泛、多数显性、多态性高、非等位检测及能检测20-100个位点,提供较高的样品信息量,可以对整个基因组进行检测,操作简便,重复、稳定、可靠性高及费用低等优点
[10]
。
2
2.1
SRAP技术在园林植物遗传育种中的研
究进展
遗传多样性分析及亲缘关系的研究
性碱基的变化与相同核心序列组合成一套正向引
primer)长18bp,物。而反向引物(R-其中核心序列由11bp填充序列(GACTGCGTACG)和特异序列
AATT组成,3'端仍为3个选择性碱基。正向引物中的CCGG序列可与ORF区域中的外显子特异性结合,反向引物中的AATT序列特异结合于富含AT区的内含子和启动子。这样正反向引物结合可以同时对外显子、内含子和启动子区域进行特异性扩增,并且因为个体不同及物种的内含子、启动子和间隔序
[4]列不同而产生多态性。
1.2SRAP扩增程序及检测方法
遗传多样性反映了种内不同种群之间或一个种
[11]
群内不同个体间的遗传变异。遗传多样性分析可以为研究物种起源、品种分类、亲本选配和品种保护等提供重要的科学依据,是收集、保护和有效利用有利于培育出更优良的品种。种质资源的技术基础,
SRAP分子标记技术可以有效地分大量证据表明,
[12]
析园林植物遗传多样性。蹇黎等利用SRAP技
37个中国术对51个寒兰品种类型(14个日本寒兰、
寒兰)进行了亲缘关系分析,用11个SRAP引物组
SRAP技术采用复性变温法扩增,扩增程序一
[2]
般有两种:一种是由Li等创立,即:94℃预变性5min;94℃变性1min,35℃复性1min(也有用33℃[5]),72℃延伸1min,5个循环;94℃变性1min,50℃复性1min(也有用53℃),72℃延伸1min,35个循环;最后72℃延伸5-10min;4℃保存。前5个循环采用35℃退火温度有利于引物与靶序列更好的结合,随后的35个循环采用50℃退火温度以保证扩增产物以指数方式扩增。另一种由Budak等[6]提出,其他条件不变,只是整个反应过程退火温度一直是47℃。这两种方法都能得到重复、稳定性较好的扩增产物,因此可根据不同试验材料和不同试验目的,进行适当调整和优化,以期达到最好的试验效果。SRAP的扩增产物一般用4%-6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,可以用同位素或银染技术检测,也可以用1.8%-2.0%的琼脂糖凝胶
[2,3,8]
。分析多态性,但分辨率较低
SRAP操作简单,采用含17-18个碱基的正反向引物及50℃的退火温度,确保了扩增产物的稳定
[2]
[5]
合共扩增出586条带纹,其中504条多态性带纹,多
态率为86.01%,有效揭示了材料间的遗传关系。用19个SRAP引物组合对文心兰的33个品种基因组DNA进行扩增,结果显示,文心兰种周艳霞等
质具有丰富的遗传多样性,同时也说明了SRAP标记可有效应用于文心兰种质资源的遗传多样性研
[14]
究。李梅等利用SRAP分子标记研究了桂花(OsmanthusfragransLour.)88个品种和1个野生种间的亲缘关系,得出品种群体间遗传分化程度高的结论。SRAP技术在开发野生种质资源方面也起到
[15]
了重要的作用。袁菊红等对中国13个省24份野生石蒜(Lycorisradiata)94个样品进行了SRAP扩增,发现石蒜的野生种质资源遗传多样性非常丰富,种源间遗传分化显著。樊洪泓等利用SRAP和RAPD两种分子标记技术对石斛的9个品种进行了遗传多样性研究,表明SRAP聚类结果与传统的基于形态特征建立的分类结果较为一致,同时说明SRAP标记在石斛的遗传多样性与亲缘关系的研究
[17]
中,表现出了极大的优越性。Han等利用25对SRAP引物对发生芽突变的两个牡丹中国栽培品种
[16]
[13]
电泳
[7]
性
,并且还可以通过改变引物3'端的3个碱基得
到更多的引物,加上正反向引物可以自由组合,提高了引物的使用率,大大降低成本。与目前广泛应用
[9]
和两个牡丹日本栽培品种的亲缘关系进行了分析,
结果证明,中国栽培品种和日本栽培品种在遗传性上差别很大,并且表明了SRAP标记在分子水平上