RNA提取 RT-PCR技术专题
发布时间:2024-11-08
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RNA提取技术
“从RNA提取到荧光定量 从 提取到荧光定量PCR”解决方案 提取到荧光定量 解决方案 ―核酸纯化系统TIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO.,LTD
市场部
蒋彦波
2008年4月 武汉 2008年
RNA提取技术
RNA相关知识及提取原理 相关知识及提取原理 RNA提取流程 提取流程 特殊组织RNA的提取 的提取 特殊组织 RNA的评价、鉴定与保护 的评价、 的评价 TIANGEN公司 公司RNA提取产品选择指南 公司 提取产品选择指南
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细胞中RNA的种类和含量 的种类和含量 细胞中不同丰度 高丰度 组织名称 肝脏 脾脏 心脏 大脑 中丰度 胚胎 肾脏 肺 膀胱 低丰度 骨 脂肪 高丰度 中丰度 低丰度 成纤细胞 人白细胞 酵母 拟南芥叶片 烟草叶片 玉米叶片 样品量 1mg 1mg 1mg 1mg 1mg 1mg 1mg 1mg 1mg 1mg 105 105 105 1mg 1mg 1mg 0.50.5-1μg 0.50.5-1.5μg 0.20.2-0.5μg 0.050.05-0.1μg 0-0.05μg 0.050.05-2μg 2-4μg AAAAAA 总RNA含量 RNA含量
RNase
rRNA
tRNA
AAAAAA mRNA
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RNA提取的基本方法 提取的基本方法——裂解原理不同 提取的基本方法 裂解原理不同异硫氰酸胍/苯酚法 异硫氰酸胍 苯酚法细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解, 细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解,同时核蛋 白体上的蛋白变性, 白体上的蛋白变性,核酸释放 释放出来的DNA RNA由于在特定pH下溶解度的不同而 DNA和 由于在特定pH 释放出来的DNA和RNA由于在特定pH下溶解度的不同而 分别位于整个体系中的中间相和水相,从而得以分离 分别位于整个体系中的中间相和水相,
胍盐/β-巯基乙醇法 胍盐 巯基乙醇法盐酸胍裂解样本,抑制RNase的活性 盐酸胍裂解样本,抑制RNase的活性 RNase β-巯基乙醇变性蛋白
RNA提取技术
RNA提取的基本方法 提取的基本方法——吸附方法不同 提取的基本方法 吸附方法不同沉淀法 介质吸附吸附材料 硅基质 阴离子交换树脂 磁珠 纯化原理 高盐低pH值结合核酸 高盐低pH值结合核酸 pH 低盐高pH pH值洗脱 低盐高pH值洗脱 低盐高pH值结合核酸 低盐高pH值结合核酸 pH 高盐低pH pH值洗脱 高盐低pH值洗脱 磁性微粒挂上不同基团可 吸附并携带RNA 吸附并携带RNA
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RNA相关知识及提取方法原理 相关知识及提取方法原理 RNA提取流程 提取流程 特殊组织RNA的提取 的提取 特殊组织 RNA的评价、鉴定与保护 的评价、 的评价 TIANGEN公司 公司RNA提取产品选择指南 公司 提取产品选择指南
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样品前处理——实验材料的选择 样品前处理——实验材料的选择 ——
选择新鲜血液,不得超过4 选择新鲜血液,不得超过4小时选择新鲜、生长旺盛的组织 选择新鲜、
选择新鲜的幼嫩组织 选择处于生长旺盛的时期收集细胞
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样品前处理——实验材料的保存 样品前处理——实验材料的保存 ——可将新鲜血液先进行红
细胞裂解,得到白细胞, 可将新鲜血液先进行红细胞裂解,得到白细胞, 然后加入一定量的TRNzol TRNzol, 70℃保存较长时间 然后加入一定量的TRNzol,-70℃保存较长时间
推荐使用专门的RNA样品 推荐使用专门的RNA样品 专门的RNA 储存液进行储存 储存液进行储存
液氮保存, 液氮保存,避免反复冻融 去掉培养基,加入一定量TRNzol 去掉培养基,加入一定量TRNzol ℃保存较长时间 -70 ℃保存较长时间
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样品前处理——处理方式 样品前处理——处理方式 ——液氮研磨 匀浆或液氮研磨 应用红细胞裂解液处理 直接裂解或胰蛋白酶处理
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样品前处理——常见问答 样品前处理——常见问答 ——
Q-1:样品量是否越多越好?最大量 样品量是否越多越好? RNA RNA
预期得率 A-1:不是。在试剂盒规定内增加,若过度增加样品处理量会 不是。在试剂盒规定内增加, 得 影响RNA得率 影响RNA得率; 率 得率; 如增加样品起始量, 如增加样品起始量,则后续实验中各溶液量均要相应按比 例增加。 例增加。 实 得率
处理样品量
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样品前处理——常见问答 样品前处理——常见问答 ——
Q-2:如何保证研磨过程和匀浆中RNA不被降解? 如何保证研磨过程和匀浆中RNA不被降解 不被降解? A-2:研磨过程要迅速,同时尽量避免外源RNA酶污染; 研磨过程要迅速,同时尽量避免外源RNA酶污染 酶污染; 匀浆过程中一定要保证组织和裂解液充分接触,尽量在 匀浆过程中一定要保证组织和裂解液充分接触, 匀浆前将组织低温切割成小块加入裂解液中, 匀浆前将组织低温切割成小块加入裂解液中,可确保 RNA不被降解。 RNA不被降解。 不被降解
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细胞裂解--释放RNA 细胞裂解--释放RNA --释放异硫氰酸胍/酚 异硫氰酸胍 酚-TRNzol、TRNzol-A+总RNA提取试剂 、 - + 提取试剂 胍盐/β-巯基乙醇 RNAprep pure系列RNA提取试剂盒 pure系列 系列RNA提取试剂盒 胍盐 巯基乙醇— 巯基乙醇 独特配方-植物RNA提取试剂 独特配方 RNAplant植物 植物 提取试剂
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RNA纯化与获得-- 纯化要求 纯化与获得-- 纯化与获得RNA纯化要求
纯化后不应存在对酶(如逆转录酶) 1 纯化后不应存在对酶(如逆转录酶)有抑制作用物质 蛋白质、 2 蛋白质、多糖和脂类分子等的污染降低到最低程度 排除DNA DNA分子的污染 3 排除DNA分子的污染
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实验举例及注意事项
使用试剂(以TRNzol-A+为例) 使用试剂( TRNzol- 为例) 使用试剂盒(以RNAprep pure试剂盒为例) pure试剂盒为例 试剂盒为例) 使用试剂盒(
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样品前处理、 样品前处理、细胞裂解 试剂 试剂盒
抽提
加入吸附柱
操 作沉淀 加去蛋白液 和DNase I
洗涤 漂洗 溶解RNA沉淀
溶解RNA沉淀 RNA RNA洗脱收集 RNA洗脱收集 获得RNA产物 获得RNA产物 RNA
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TRNzol-A+试剂法提取 试剂法提取——加量 加量
样品处理量与加入的TRNzol-A+的量要对应 的量要对应 样品处理量与加入的 1ml TRNzol-A+对应: 对应: 对应 血液 0.3ml 动植物组织30-50mg 动植物组织 贴壁细胞: 贴壁细胞:每10cm2培养面积 悬浮细胞: 悬浮细胞:5-10×106细胞 ×
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