β-1,4-葡聚糖内切酶基因的克隆及表达
发布时间:2024-08-27
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华南理工大学学报(自然科学版)
第36卷第12期2008年12月
JoumalofSoumChinaUniversityofTechnology
(NaturalScienceEdition)
V01.36December
No.122008
文章编号:1000—565x(2008)12一0112—04
卢一l,4一葡聚糖内切酶基因的克隆及表达水
郭成栓
崔堂兵+
郭勇
(华南理工大学生物科学与工程学院,广东广州510006)
摘要:从一株产碱性纤维素酶的短小芽孢杆菌菌株H9中,克隆到了编码葡聚糖内切酶
的基因,对其基因序列及酶的结构域进行了分析预测,同时将该酶的基因构建于大肠杆菌
表达载体pE他0b中,获得重组表达载体pE他ob-%fA,转化至大肠杆菌菌株B12l(DE3)
中进行表达,并进行十二烷基硫酸钠一聚丙烯酰胺凝胶电泳检测.实验结果表明:该基因大小为1980bp,共编码659个氨基酸,在大肠杆菌中得到了良好的分泌表达;该酶的相对分子质量约为73000,由两个不连续的结构域组成,其一为N一端催化结构域,由糖基水解酶家族9组成,其二为c.端底物结合结构域,由碳水化合物绑定结构域家族3组成,其在不同温度和pH值下的活力和稳定性与原始菌株的比较接近.
关键词:葡聚糖内切酶;大肠杆菌;短小芽孢杆菌;基因;克隆;表达
中图分类号:Q78文献标识码:A
.
碱性纤维素酶是一种可以在碱性条件下发挥催化作用的届一1,4.葡聚糖内切酶,广泛应用于洗涤剂、脱墨等行业¨4j.洗涤剂中加入酶制剂,一方面可去除棉纤维上的污垢,另一方面还能起到使棉织物颜色鲜明和柔软的效果.与酸性纤维素酶不同,碱性纤维素酶是一种缺少葡聚糖外切酶和葡萄糖苷酶的非全组分的内切葡聚糖酶,不能发生酶组分间的协同效应.届.1,4一葡聚糖内切酶主要对棉纤维中占10%左右的非结晶区(无定形区)的纤维素分子起作用,对结晶区纤维素水解活力很低,所以并不会明显降低棉纤维的牢固度.从自然界中筛选高活力口-1,4一葡聚糖内切酶产生菌,克隆其基因并利用强启动子进行表达是提高酶产量的重要措施.目前,虽然已有一些届-1,4一葡聚糖内切酶基因被克隆并同时也得到了表达,但表达活力大部分较低.本研究应用PcR技术从一株短小芽孢杆菌H9中克隆了编码口.1,4一葡聚糖内切酶的基因,并将该基因构建在大肠杆菌
中得到了良好的表达.
1材料与方法
1.1
材料
短小芽孢杆菌菌株H9分离于土壤中,大肠杆
菌表达载体pE他0b购于Novagen公司.
LB培养基"o的组成为:1%蛋白胨,1%Nacl,0.5%酵母膏,pH=7.O,将其于121℃灭菌20min后备用.
限制性内切酶、连接酶、呦酶、pMDl8T载体及
蛋白相对分子质量标准物购于TaI(aRa公司;羧甲基纤维素(cMC)购于siglIla公司;DNA梯度标记物购于耵ANGEN公司;胶回收试剂盒购于QIAGEN公司;引物由sangon公司合成;其他试剂均为国产分析纯.
1.2
方法
DNA的提取采用十二烷基磺酸钠一蛋白酶K一
1.2.1,短小芽孢杆菌DNA的提取酚氯仿法扣1.
表达载体pE配0b中,结果显示其在重组大肠杆菌
收稿日期:2007—09—26
女基金项目:广东省工业科技攻关项目(2005810401051)
作者简介:郭成栓(1977一),博士生,主要从事酶工程研究.E—mail:gcs200222@163.com十通讯作者:崔堂兵,副教授.E_mail:fetbcui@scut.edu.cn
万方数据
第12期
郭成检等:筘-l,4一翻聚糖内切酶基因的克隆及表达
1.2.2廖,1,4一葡聚糖内切酶基因的克隆及序列分析
以抽提的H9细菌DNA作为PCR扩增的模
板,上游孳|物为5’GC零G疆誓焱C鞑霉GC3’,下游零|物
为5’TTAmAlTrcGGAAG37.PcR反应体系(50肚)
为:lo×弛9缓冲溶液5斗L,模板DNAl斗L,浓度力
lo转mo汐L的弓|物各l弘毛,10降fn出毛蠢N蕈p
l秘毛,
83.35吣'L/(s L)(5U/止)砌’DNA聚合酶o.5此,
超纯水35。5斗L,混匀.反应条件:94℃预变性5
min,
94℃变性lm遮,50℃退火l黼涵,72℃延僚2min,进行30个循环,最后72℃延伸10min.将PCR扩增得到的2kbp条带胶网收,然后与pMDl8T载体连接,转纯大肠秆菌Ⅸ差5理,筛选鬻性克隆进行序硼测定.将重组T载体送上海生工生物技术有限公司进行测序,碱基序列的比对在美囡国立生物技术信息中
心(NC转1)网站的转L焱鼹软件上进行.
1.2.3酶分子三维模型的构建
p一1,4一葡聚糖内切酶三维模型的构建在匿内瓦
生物医学研究所建立发震起来的分子模建服务系统
SwIss—Model上进行,其采用一系列工作软件,从循
白质结构数据库中提取蛋白质查询序列的模拟结构
信息,蔫具有蛋白质楣似性的已知结构强白建立未知结构蛋白的分子模型,酶结构显示和分析在软件Deepview(SWISS—Pdbviewer
Version
3.7)上进行.
1.2.4静NA的酶切、回收、连接及质粒的抽提
DNA的酶切及连接参照TaKaRa的说明书进行,DNA回收按QlACEN公司试剂盒进行,质粒的擒提参照文献[6]进行.
1.2.5
大肠杆菌表达载体的构建
以重组pMDl8T一%殛载体作为模板,重薪设计
一对弓|物5’AKTGGATCCATGCACATrI,r瞄’,
57ATcG
CTcGAGwATIvrATTcGGAAG3’,分别弓1人
&mHl和觋ol酶切位点.进行PcR扩增,反应条件同上,将扩增得到的2kbp条带用内切酶&mHI和姗oI双酶切,载体pE他ob同样用眈mHI和鼢oI
双酶切,鼹收大的片段,然后用T4DNA连接酶连接两个大的片段,转化大肠杆菌菌株B弛l(DE3),利
用LB氨苄青霉素平板筛选重组转化子,提取重组
质粒并翔内切酶酶切鉴定.1.2.6大肠杆菌的转化
大肠杆菌感受态的制备及转化参考文献[6]进行.
1。2。7
异丙基移移.硫代半乳糖蔷诱导勰牲转化子
分泌表达
挑取平板上的阳性转化子,将阳性转化子转到用
募丙基蛰一努一硫代半乳糖营(1鞭G)诱导且添懿O。2%’
羧甲基纤维素(cMC)的LB培养基平板上培养一定
万
方数据的时间,用0.2%的刚果红溶液染色20min,然后用
1
mol/L的NaCl溶液洗涤20min,观察水解圈的大小.
1.2.8辛二烷基硫酸钠一聚巍篱酰胺凝胶电泳检测
将重组大肠杆菌转化子接入含氨苄青霉素的
LB培养基中于37℃培养过夜.以2%(体积分数)
的攘种量转蓟含氨苄青霉素的潍培养基中,继续
培养至对数生长期,加入异丙基够。D.硫代半乳糖苷直到终浓度为lmmoyL,诱导培养一定时间.取上述培养菌液lm乳于室温下12∞0∥min离心lmin收
集菌体,加入100汕2×十二烷基硫酸钠(sDS)上样
缓冲液,予沸水中处理5诚n,离心取上清进行一p二烷基硫酸钠一聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—P轰cE).1.2.9酶活及稳定性试验
酶活及稳定性试验参照文献[7]进行,
2结果与讨论
2。l
酶基落的克隆及序烈分耩
应用PCR方法克隆了编码8,l,4一葡聚糖内切
酶的读码框基因序列,电泳显示该条带大小为2珐p,与墨标条带大小撩同,将该窿列克隆到零载体pMDl8T中,送上海生工生物工程技术有限公司测序.测序结果表明,该基因读码框碱基长度为19嬲bp,编码659个氨基酸.该基因序磺已被牧录于GenBank,登录号为EF501975.该基因序列与GenBank等国际核酸序列数据库的比对结果表明,其与枯草芽孢杆菌KS麓_522强。及短小芽孢括菌
s.27∞1编码的葡聚糖内切酶编码基因具有较高的同
源性,达到98%,其中与短小芽孢杆菌s一27的编码基因有30个碱基的差剃,由于密码子蓠并性的存在,反映到葡聚糖内切酶氨基酸顺序上,则有8个氨基酸的差别.
露一l,4一葡聚糖内切酶的结构域分析显示(见图
1),酶由两个不连续结构域组成:其一为N。端催化
结构域,由糖基水解酶家族9组成,该结构域主要起催他底物永解的作用,其中钧5—42l号氨基酸和455—473号氨基酸分别为酶的两个催化活性中心;
其二为c.端底物结合结梅域,由碳水化合物绑定结构域家族3组成,从50l号氨基酸残基开始到658
号氨基酸残基拭158个氨基酸残撼,可以与纤维素表露结合pj,从而使催化易于进行。薅个催他结构域之间出一段连接肽连接.酶的N一端和c一端结构不同,其中N-端催化结构域主要由仪螺旋结构组成,藤c一端结合结构域主要纛§折叠结构组成。该类结构的纤维素酶报道较少,仅在芽孢杆菌KSM巧22及
114
华南理工大学学报(自然科学版)第36卷
短小芽孢杆菌中有所发现‘9。101.该酶发挥催化作用的最适pH为碱性且作用的pH范围较广泛,是一种具有较强应用前景的洗涤剂用酶.
苄青霉素的发酵培养基中,当菌体生长到对数期后,加入诱导物IPrllG、离心收集菌体,破壁,进行sDs-PAGE分析,分别和空白菌株及未加诱导物的的转化菌株进行对比.由图3可以看出,在培养基中加入
1
mmoL/L的I阴G作为诱导物的转化菌株在相对分
子质量73000左右处有一表达蛋白条带,而未诱导
菌株及空白菌株则都没有条带,表达蛋白的分子大
小与理论值大小基本一致.
图1口一1,4一葡聚糖内切酶三维结构预测
Fig.1
3一Dimension
stmcture
predictedfor届一1,4一endoglu
2.2
表达载体的构建
两种引物分别引入了BomH
I和翮oI位点.以
重组pMDl8T.魄zA为模板,PCR扩增获得卢一1,4一葡
聚糖内切酶基因片段,长1980bp,将该基因克隆到
pE他Ob中,获得重组表达载体pE睨0b一咏fA.利用
双酶切进行验证,结果证明质粒构建成功.
2.3
阳性转化子在LB平板上的分泌表达
按照1.2.7的实验方法,届.1,4.葡聚糖内切酶
在LB.CMC平板上的分泌表达结果如图2所示.从图2可以看出,菌落周围具有较大直径的清晰的透明圈,这初步说明葡聚糖内切酶基因在大肠杆菌中得到了高效分泌表达.
图2口一l,4一葡聚糖内切酶在LB—cMc平板上的分泌表达
Fig.2
Secretedexpressionof卢一1,4一endoglucanase
on
theLB—
CMCplate
2.4
重组葡聚糖内切酶的诱导表达及分析
鉴定
将重组质粒pE他ob一必fA转化至大肠杆菌菌株
BL21(DE3)中,获得含有重组质粒的大肠杆菌BL21(DE3)重组菌株.将重组菌株转接到含10mg/L氨
万
方数据图3发酵产物的sDs—PAGE电泳分析
SDS—PAGEelectmphoreticaJlalysisoffernlentationproducts
1一添加诱导剂I丌G的大肠杆菌B121(DE3)发酵液;2一未添
重组葡聚糖内切酶的酶活及稳定性
温度对重组葡聚糖内切酶酶活及稳定性的影响
在不同温度条件下测定重组葡聚糖内切酶酶
的比值(相对酶活)作纵坐标,温度作横坐标,所得蝗龆‘拓罂
图4温度对酶活及稳定性的影响
Fig.4
Effectsoftemperature
on
enzymeactivityand
stability
Fig.3
加诱导剂IPI'G的重组大肠杆菌BL21(DE3)/pE,120b一尉A发酵液;
3~添加诱导剂I门G的重组大肠杆菌BL2l(DE3)/pE,120b一坛fA发酵液;M一蛋白相对分子质量标准物2.5
2.5.1
活,以不同温度下的酶活与最适温度(55℃)下酶活
结果见图4.结果表明,重组葡聚糖内切酶酶活随温
第12期
郭成栓等:届一1,4一葡聚糖内切酶基因的克隆及表达
115
度升高而升高,温度达到55℃时,酶反应速度最快,温度继续升高,反应速度反而下降.将重组葡聚糖内切酶分别在30℃至70℃的条件下保温一定时间,检测剩余的酶活,以不同温度下的残余酶活与最稳定
温度(30℃)下残余酶活的比值(相对残余酶活)作
纵坐标,温度作横坐标,所得结果见图4.结果表明,重组葡聚糖内切酶在55℃以下时具有较好的稳定性,随着温度的升高酶的稳定性下降,酶在不同温度下的活力与稳定性与原始菌株H9的比较接近.
2.5.2
pH值对重组葡聚糖内切酶酶活及稳定性的
影响
在不同pH条件下分析重组葡聚糖内切酶的活力,以不同pH值下的酶活与最适pH值(pH=8)下酶活的比值(相对酶活)作纵坐标,温度作横坐标,所得结果见图5.结果表明,该酶最适pH值在8左
右,在7~9之间都具有较高的酶活.将重组葡聚糖
内切酶在不同pH值的缓冲液于4℃保温1h,检测
剩余的酶活,以不同pH值下的残余酶活与最稳定
pH值(pH=7)下残余酶活的比值(相对残余酶活)作纵坐标,温度作横坐标,所得结果见图5.结果发现,该酶在pH=5~9时具有较好的稳定性;而在pH值小于4或大于10的条件下酶活丧失较快,与原始菌株H9产生的葡聚糖内切酶基本一致.酶在不同pH值下的活力与稳定性与原始菌株H9比较接近.
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图5
pH对酶活及稳定性的影响
Fig.5
EfkctsofpHon
enzymeactivityand
stability
3
结论
应用PcR方法克隆了短小芽孢杆菌J8—1,4-葡
聚糖内切酶基因.基因序列分析表明,该基因读码框为1980bp,编码659个氨基酸.对酶的三维结构研究结果表明,该类酶有两个功能区域,一是N.端由糖基水解酶家族9序列组成的区域,起催化作用,二
万
方数据是c一端的结合区域,由碳水化合物绑定结构域家族3组成,从501号氨基酸残基开始到658号氨基酸残基共158个氨基酸残基,可以与纤维素表面结合,两个结构域之问由一段连接肽进行连接.
将卢一1,4.葡聚糖内切酶基因构建在大肠杆菌表达载体pE他ob中,得到重组表达载体pErll20b一
魄fA,将重组载体转化大肠杆菌BL21(DE3),获得
B121(DE3)重组菌株.在诱导物IPl’G的诱导下,口一1,4.葡聚糖内切酶基因在大肠杆菌中实现了高效分泌表达,为该酶的后续定向进化研究及应用奠定了,良好基础.参考文献:
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ClassofBiharmoIlic
HardyPotential
耽昭y0M咖凡.s^饥玩。一如n
(Department
ofMathematics,southchinauniversityofTechnology,Guangzhou510640,GuaIl酊ong,china)
Abstract:Inthispaper,anewSobolevspaceisestablishedandeigenvaluepIDblemofthePassLemma
a
compacteIIlbeddingtheoI℃misgiVen.Then,the
biha瑚onic
equationwithcriticalexponentsisanalyzed.FinaUy,byusingtheMountain
a
satisfying
theCeramieondition,theexistenceofthenontriVials01utionsto
classof
biha珊onic
equa。
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(school
ofBiologicalscienceandEngineering,southchinauniversi‘yofTechnology,Guangzhou
5l0006,Guangdong,china)
Abstract:口一1,4.endoglucanaseencoding
genewas
clonedfromB口ciZfwpumiZ嬲H9pmducingalkalinecellulase,Then,thegenewascloned
was
withitssequenceanddomainbeingalsoanalyzed.karyoticexpressionvectorstrain.show
pET20b,
and
the
into—酞c危eric^i口co屁(E.co髓)pID-
to
a
constmctpET20b一点酱fA
transf0珊ed
E.co庇BL2
1(DE3)
Finallv,byusingtheSDS.PAGEelectrophoresis,theexpressedproductwasdetected.Experimentalresults
that(1)the口一1,4.endoglucanase
gene
sequence,1980bpinsizewith659aminoacidsbeingcoded,isef-
with
a
fectivelvexpressedinE.cD尻;(2)the口.1,4.endoglucanase
an
relativemolecularmassofabout73000consists
oftwodiscontinuousdomains:oneisandtheotheris
a
N.te珊inal
at
catalyticdomainbelongingtothe91ycosidehydr01asefamily9
to
C.ternlinalcellulose.bindingdomainbelonging
thecarbohydrate3;and(3)the
are
actiVityand
to
stabilitvoftherecombinanttheoriginalstmin.Key
JB.1,4一endoducanase
differenttempemturesandpHValues
bothclosethoseof
words:endoducanase;点_c^eric九施co屁;Bnc珊w
pMm以w;gene;cloning;expression
万方数据
β-1,4-葡聚糖内切酶基因的克隆及表达
作者:作者单位:刊名:英文刊名:年,卷(期):被引用次数:
郭成栓, 崔堂兵, 郭勇, Guo Cheng-shuan, Cui Tang-bing, Guo Yong华南理工大学,生物科学与工程学院,广东广州,510006
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本文链接:http://www.77cn.com.cn/Periodical_hnlgdxxb200812022.aspx
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