酵母双杂交实验流程(6)
发布时间:2021-06-06
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rpm,16~18 hr,培养至OD600值>0.8。
(2)1,000 g离心5 min,弃上清。用剩余的5 mL左右残液重悬细胞。
(3)室温水浴融化冻存的文库(约1 mL),轻柔震荡,留取10 L文库用于文库滴度测定(文库滴
度测定方法见后)。
(4)快速将步骤2和步骤3的两种液体混合到2 L的烧瓶中并加入45 mL 2ХYPD/Kan(Kan50 g/mL)
轻柔震荡;用1 mL 2 YPD/Kan冲洗装文库的离心管两次,并将冲洗液加入到烧瓶中。 (5)30 ℃过夜孵育(20~24 hr)并轻柔震荡(30~50 rpm)。
(6)将杂交混合液转移到一无菌离心瓶中,1,000 g离心10 min,弃上清。再用50 mL 2×YPD/Kan
冲洗杂交瓶两次,将两次冲洗液混合在一起重悬细胞。
(7)1,000 g离心1 0 min,弃上清。用10 mL的0.5 YPD/Kan重悬细胞,并估算重悬后的总体积,
铺板。
(8)倒置平板于30 ℃孵育8~21天直到克隆出现。
(9)挑取阳性克隆于300 L YPDA和150 L消毒甘油的混合液中,冻存于-80 ℃。 阳性克隆验证:
(1)用接种环挑取单个阳性克隆接种到新的SD/-Trp/-Leu/-His/ X-Gal 平板上,30 ℃倒置平板孵育。 (2)待阳性克隆长出后,再用接种环挑取单个阳性克隆,接种到新的SD /-Trp/-Leu/-His/X-Gal 平板
或SD/-Trp/-Leu/-Ade/ -His/X-Gal 平板上,倒置平板于30 ℃孵育。
(3)挑取单个阳性克隆于5 mL YPDA/Kan培养基中30 ℃,250~270 rpm振摇12~16 hr。 (4)使用酵母质粒微量抽提试剂盒提取质粒。
(5)将提取到的质粒混合物(BD/bait、AD/cDNA)采用经典转化法转化DH5 大肠杆菌,铺LB抗
生素平板。LB平板中的抗生素与AD/cDNA载体所带的抗性一致,这样最终得到的克隆只含有AD/cDNA。
(6)挑取单个阳性克隆于5 mL LB培养基(含相应抗生素)中37 ℃,250~270 rpm振摇12~16 hr。 (7)提取质粒,做PCR鉴定。
(8)将pGADT7-cDNA表达质粒转入AH109酵母株中将pGBKT7-bait表达质粒转入Y187酵母中,
待克隆长出对带有AD-文库蛋白的AH109酵母克隆进行自激活验证,另外再将带有AD-文库蛋白的AH109酵母克隆与带有BD-bait蛋白的Y187酵母克隆进行杂交,验证阳性克隆的真实性。
文库cDNA片段的PCR鉴定
—2 000bp
—2 000bp —500bp
—500bp
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2 000bp —500bp
—2 000bp —500bp