代谢网络通量和结构分析--硕士(15)

代谢网络通量和结构分析

代谢网终通量和结构分析

了在一条边上很多个优化点。

藩１３，１代自｝平衡分析过耩

Ｆｉｇ．１．３．１Ｍｅｔｈｏｄｏｌｏｇｙｆｏｒｆｌｕｘｂａｌａｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓ

对于一个给定的翻标函数（ｚ），可戳通过葳璧平衡（ｓｖ；Ｏ）和线性不等式（日＜ｖｉ《ｂ０约束得到优化的通量分布。当然，也可能某种情况下出现系统优化点位于一条边上而不在一个点上（图１．３．１ｄ），这耱｛生涯零国凌在系统瓣鳇素羧蠲正努平毒亍手嚣拣函数。在这种情况下，沿着这祭边上系统出现很多优化解。混合整型线性规划（ＭＩＬＰ）方法能够医分识别这些相似盼优化解［挪ｑ。

１３．４代谢平衡分析宵法的扩艘

ＦＢＡ的主要假设是通过实现菜些晷檬而优纯生亿睡络行为。这摊假设；ｌ越了镬犬关注，并且进～步发震，生成具有生物学懑义的其它ＦＢＡ补充方法州ｊ。

（１）结合不同的附加约束

调节约束首先作为寿尔递瓣算簿应瘸子ＦＢＡｌ３”，调节懿寨表遮了瓣对逶豢麴柬，这取决予特殊的环境而不魅生理化学约束（不考虑时间、空间，表示基本的限制），使用布尔逻辑算德，可以基于壤腿系绫起始条秽计算调繁约衷。然嚣执行梅准躲ＦＢＡ（对生长速率优化）。得刘的解空间被用于再次计算调节约柬。这个过程可以在时间允许的条件下

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